MySQLです。GMOクラウドではバージョンが5.1だったので、phpMyAdminが動かなかったのと、mysqlでGRANT ALL PRIVILEGESがうまくいかなかったので、5.6にアップグレード。
やり方はさくらのVPS MySQLのアップデートを参考に。
アップデートできたのはいいが、GRANT ALL PRIVILEGESがエラーになる。
ネットを調べると5.6のバグとのこと。
「MySQLを5.1から5.6.10に上げたらなんか壊れた話」を参考にデータベースをアップグレードしたらうまくいくようになった。
WordPressはさくらのVPS WordPressのインストールとさくらのVPS WordPressの再インストールを参考にやったらできた。